Платить НДС при импорте (ввозе) товаров должны все импортеры независимо от системы налогообложения. Налог уплачивает декларант или иные лица, например, перевозчик (ст. 143 НК, ст. 150 ТК ЕАЭС). Если товар декларирует таможенный представитель (брокер), то он является ответственным за уплату НДС (ст. 405 ТК ЕАЭС). Исключение: импорт из стран ЕАЭС. В этом случае НДС тоже платят, но через налоговые инспекции, а не на таможне.
Обязанность платить НДС при ввозе товаров предусмотрена пп.4 п.1 ст.146 НК и она не зависит от того, является ли ввозящее лицо плательщиком НДС или нет, а также от объемов продаж и от стоимости ввозимых товаров. То есть риски доначисления ввозного НДС есть, даже если было ввезено товаров на сумму только 500 тыс. рублей. Не уплачивается НДС в случаях, предусмотренных ст. 150 НК, а также таможенным кодексом. Например, не платится НДС при ввозе товаров для личных нужд не связанных с предпринимательством (ст. 266 ТК ЕАЭС) или при ввозе медицинских товаров по перечню из постановления Правительства от 30.09.2015 № 1042 (п. 2 ст. 150 НК).