Есть ли налоговые режимы, которые не позволяют работать с маркетплейсами?

ИП на патенте не может работать с маркетплейсами, так как патентная система налогообложения не предусматривает патенты на торговлю через интернет.

Самозанятый на НПД при перепродаже товара. Напомним, налог на профессиональный доход (НПД) может использоваться самозанятыми лицами для осуществления коммерческой деятельности. Этот режим подходит тем продавцам, кто реализует собственные товары. Однако применение налога на профессиональный доход (НПД) не позволяет самозанятому закупать продукцию у производителей и затем продавать ее на электронных площадках с наценкой.

ООО или ИП на АУСН. Данная система является экспериментальным налоговым режимом, используемым в некоторых регионах России, она не подходит для работы по комиссионным или агентским договорам, которые используются при работе с маркетплейсами.